Cara copy direktori beserta isinya pada Linux

Kemarin malam saya melakukan kesalahan fatal dimana melakukan modifikasi website tapi backup hanyalah dengan melakukan copy direktori saja. Asumsi saya dengan cp nama_dir sudahlah cukup dan kalau ada masalah tinggal direname atau dikembalikan isinya. Ternyata salah besar. Entah kenapa saya kelewatan kalau ada pesan peringatan cp: omitting directory 'nama_dir' dan gara – gara ini saya…